1、作用時間短，殺菌效果好
微波特殊的傳熱方式，在短時間內利用熱效應和非熱生物效應對物料內外同時進行更深層次的殺菌。
2、 制品品質好
微波殺菌大限度的保持了原有物料的色、香、味和物理外和營養成份。
3、經濟環保
微波殺菌不會產生污染和污染殘留物，，操作安全簡便 ，與鈷60相比，成本大大降低。
4、方便快捷
因大部分包裝物對微波是"透明"的，可以對包裝后的物料連同包裝進行殺菌處理，減輕了勞動強度，操作方便、快捷。
微波滅菌有什么優點
1、時間短、速度快常規熱力干燥殺菌是通過熱傳導，對流或輻射等方式將熱量從物體表面傳至內部。往往需要較長時間，物體內 部才能達到所需的干燥度和殺菌溫度。介質由極性分子和非極性分子組成，電磁場作用下，這些極性分子從原來的隨機分布狀態轉向依照電場的極性排列取向。而在高頻電磁場作用下，這些取向按交變電磁的頻率不斷變化，這一過程造成分子的運動和相互摩擦從而產生熱量。此時交變電場的場能轉化為介質內的熱能，使介質溫 度不斷升高，故微波加熱是介質材料自身損耗電場能量而發熱。所以微波加熱處理時間大大縮短，在一定功率密度強度下，一般只要數十秒、幾分鐘即能達到滿意效果。
2、低溫干燥殺菌保持營養成份微波有熱效應的快速升溫和非熱效應的雙重殺菌作用，相比常規熱力干燥、殺菌能在比較低的溫度和較短的時 間就能獲得所需的干燥、殺菌效果。一般殺菌溫度在65—70。C，75—80。C或103—121。C里，時間在3—8分鐘，且能保留更多的食品營養成分 和色、香、味、形等風味。
3、節約能源微波電能轉換效率高，一般在70%以上。微波是直接對食品進行作用處理，加熱箱體本身不被加熱，因而不存在額外的熱能損耗，所以節能省電，一般可節電30—50%。
4、均勻常 規熱力干燥、殺菌是從物料表面開始，然后通過熱傳導傳至物料內部。物料內外溫度存在溫差，內外干燥、殺菌效果 一致性差。為了保持風味，縮短處理時間，往往內部達不到足夠溫度而影響干燥、殺菌效果。采用提高處理溫度可有所改善這一現象，然而這使物品表面的色、香、 味、形等品質下降。微波具有穿透性能，表面和內部同時作用，能保證內、外部溫度一同達到要求值，所以干燥、殺菌均勻、。
5、便于控制、易實現自動化生產微波食品干燥、殺菌處理設備操作簡單，便于控制，沒有熱慣性，能根據不同食品工藝規范要求進行處理，減少生產操作人員，降低生產成本。
6、設備簡單、工藝先進與常規殺菌相比，微波殺菌設備不需要鍋爐、管道系統、煤場和運輸車輛等，只要具備水、電基本條件即可，對廠房無特殊要求，投資少、見效快。
7、改善勞動條件、節省占地面積微波設備無高溫、無奈熱、本身不發熱，無熱輻射。可大大改善勞動條件，而且設備結構緊湊、節省廠房面積。
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